У меня нет опыта работы с VSTS, но я могу вспомнить ситуацию, когда LoadRunner также извлекает РЕСУРСЫ страницы, тогда как VSTS извлекает только HTML-страницу.
Если это так, то LR автоматически приметдольше, так как он делает больше запросов и загружает гораздо больше данных.