Дополнение к тому, что сказал ocdecio (что абсолютно правильно):
Если вы хотите сделать установку без вывода сообщений по умолчанию, то есть стандартное действие по установке, когда пользователь дважды щелкает ваш установочный файл, вы можете заключить MSI в самораспаковывающийся исполняемый файл, созданный IExpress.
IExpress входит в состав Windows и позволяет указать команду, которая будет выполняться после извлечения пакета IExpress. В вашем случае вам придется указать
msiexec /i mySetup.msi /q
в качестве команды установки (в некоторых случаях вам потребуется / qn для абсолютного подавления всех диалогов).