Протокол POP3 вообще не поддерживает папки, поэтому вы можете получить только INBOX.
Все остальные папки хранятся локально в каждом POP3-клиенте, поэтому, если вы пишете один, вы можете делать это любым удобным для вас способом.
Могут быть серверы POP3, которые позволяют использовать папки через расширения, но в этом случае они не следуют стандартному протоколу, и вы, скорее всего, внедрите что-то свое или попытаетесь найти какой-то пакет, специфичный для этого почтового сервера.
Если вы хотите использовать серверные папки стандартным способом, я предлагаю вам взглянуть на IMAP. Большинство почтовых провайдеров поддерживают как POP3, так и IMAP, и оно поддерживает хранение папок на сервере (включая черновики, отправленную почту и другие настраиваемые папки).