Вы не пишете, откуда вы взяли свою версию "5.9". Вы используете Debian, Ubuntu или какую-либо другую производную Debian?
Debian фактически упаковывает невыпущенную версию. В моей системе ctags-exuberant сообщает о своей версии как Exuberant Ctags 5.9~svn20110310, что означает, что она скомпилирована непосредственно из репозитория SVN, как это было 2011-03-10.
Это отмечено в журнале изменений Debian пакета (/usr/share/doc/exuberant-ctags/changelog.Debian.gz):
exuberant-ctags (1:5.9~svn20110310-1) unstable; urgency=low
* New upstream release snapshot (thanks, Daniel Hahler; LP: #732860).
«LP: # 732860» относится к Ошибка панели запуска # 732860 , где обсуждается новый выпуск.
Так что sourceforge.net - это еще место для разработки ctags, просто они давно не выпускали релиз.