У меня была та же проблема, и я последовал ответу @ Raph, и это сработало. После этого у меня возникла другая проблема, Netbeans вернул это сообщение об ошибке:
Deployment error: Starting of Tomcat failed, check whether the /Applications/Tomcat/bin/catalina.sh and related scripts are executable
Чтобы решить эту проблему, в терминале я перешел на tomcat-folder / bin и выполнил:
chmod 755 *.sh
И это решило мою проблему, потому что это сделало скрипты исполняемыми.