Вы можете отфильтровать типы файлов, которые игнорируются подключаемым модулем TFS для Eclipse, с помощью команды Project игнорировать функциональность подключаемого модуля, которая предоставляется .tpignore файлами .
Если вы используете SP1 плагина TFS для Eclipse (и мы бы рекомендовали обновить его, если у вас его нет), вы можете просто щелкнуть правой кнопкой мыши по папке и выбрать Team> Ignore.