В стандартной конфигурации нет способа настроить TFS так, чтобы не отмечать все файлы как прочитанные только во время действия Получить последнюю версию .
Как вы, вероятно, знаете, это можно сделать в качестве второго отдельного шага в шаблоне сборки TFS путем настройки или использования команды tf edit из командной строки.
Хороший пост о внутренней работе команды TFS Get доступен по адресу: http://www.codeproject.com/Articles/243654/TFS-Get-Latest-VS-Get-Specific-Version. В этом же посте также даются предложения по самостоятельному написанию инструмента, способного использовать TFS API. Конечно, в этом случае вы можете делать все, что захотите.