Хммм.
Вы можете создать проект веб-приложения на основе Maven ... который не требует выбора сервера при создании проекта.
Вы можете создать Antоснованный проект, тоже.Вы просто избегаете использования пунктов меню «Выполнить / Развернуть / Отладить / Профиль», и проект не будет развернут, поэтому он не будет автоматически развертываться при внесении изменений .... Автоматическое развертывание запускается после развертывания проекта в сеансе использования IDE.