Когда вы говорите файлы вашего веб-приложения, я не уверен, что именно вы имеете в виду.
Если вы имеете в виду развернутый код, вероятно, не имеет смысла использовать EBS. То, что вы хотите сделать, - это создать AMI с вашими предварительными условиями, затем создать скрипт для создания экземпляра этого AMI и развернуть ваш последний код. Я настоятельно рекомендую вам автоматизировать и протестировать этот процесс, так как легко забыть о некоторых настройках, которые вы должны где-то изменить вручную.
Если вы храните файлы данных, которые были изменены запущенным приложением, EBS может иметь смысл. Если это что-то вроде загруженных пользователем изображений или похожих, вы, вероятно, обнаружите, что S3 дает вам гораздо более простую модель.
EBS подойдет для: баз данных, люценовых индексов, файловой CMS, репозитория SVN или чего-либо подобного.