предельная сумма в таблицах - PullRequest
24 голосов
/ 11 июля 2011

У меня есть фрейм данных с количеством инфекций, идентифицированных из клинических изолятов в разные даты.

До сих пор я организовал данные в форму, с которой я хочу начать работать. Я пытаюсь подготовить серию таблиц таблиц для описательной статистики отчета.

Я использовал ftable и получаю следующее:

onset.types <- ftable(SAB$Onset,SAB$MRSA.Type,year(SAB$Collection.Date))
                             2005 2006 2007 2008 2009 2010

Community                     454  472  512  499  525  512
          AUS-2/3-like         28   23   27   29   32   38
          EMRSA-15-like         9    4    4    9    8    8
          nmMRSA               40   47   53   39   64   60
          Other mMRSA           1    3    3   11    5    9
          unclassified MRSA     0    2    0    0    1    1
Hospital                      163  163  156  164  149  165
          AUS-2/3-like         31   33   27   31   29   28
          EMRSA-15-like         3    8    5    9    4    3
          nmMRSA               10    9   13   17   13   12
          Other mMRSA           5    1    6    2    3   10
          unclassified MRSA     2    0    1    0    0    0

Два вопроса:

1: Как бы я рассчитал предельные итоги

2: существует ли простой способ подсчета процентов и повторных подсчетов с предельными итогами

Я пробовал эпитулы и не нашел их такими полезными, как хотелось бы.

Большое спасибо.

Ответы [ 2 ]

43 голосов
/ 11 июля 2011

Чтобы добавить поля, используйте addmargins()

addmargins(table(state.division, state.region))
                    state.region
state.division       Northeast South North Central West Sum
  New England                6     0             0    0   6
  Middle Atlantic            3     0             0    0   3
  South Atlantic             0     8             0    0   8
  East South Central         0     4             0    0   4
  West South Central         0     4             0    0   4
  East North Central         0     0             5    0   5
  West North Central         0     0             7    0   7
  Mountain                   0     0             0    8   8
  Pacific                    0     0             0    5   5
  Sum                        9    16            12   13  50

Чтобы рассчитать проценты, используйте prop.table()

prop.table(table(state.division, state.region))
                    state.region
state.division       Northeast South North Central West
  New England             0.12  0.00          0.00 0.00
  Middle Atlantic         0.06  0.00          0.00 0.00
  South Atlantic          0.00  0.16          0.00 0.00
  East South Central      0.00  0.08          0.00 0.00
  West South Central      0.00  0.08          0.00 0.00
  East North Central      0.00  0.00          0.10 0.00
  West North Central      0.00  0.00          0.14 0.00
  Mountain                0.00  0.00          0.00 0.16
  Pacific                 0.00  0.00          0.00 0.10
1 голос
/ 07 мая 2018

Также работает с пакетом опросов svytable().

addmargins(svytable(formula = ~x1+x2, design = df.w))
...