В зависимости от опций, которые вы указали при создании вашей dll, вам может не понадобиться перекомпилировать ее вообще. Чтобы загрузить dll, в R наберите
dyn.load("/path/to/file.dll")
и затем, если ваша экспортируемая подпрограмма sub
, используйте
.Fortran("sub", ...)
чтобы позвонить.