Если JavaScript находится внутри PHP-файла, вы можете просто сделать:
toolTip.innerHTML = "<?php echo $someVariableToPrint; ?>";
Фрагмент PHP будет проверен на сервере перед отправкой страницы клиенту, так что клиентПолучает:
toolTip.innerHTML = "The text in the variable";
Обновление
На основании дополнительной информации, указанной в вашем комментарии, ваш код будет:
toolTip.innerHTML = "<?php echo CBTxt::_('text here'); ?>";