Вы не можете зарегистрировать код на нескольких серверах по многим причинам. Одной из причин является ожидаемое изменение. Как только вы зарегистрируете их, они больше не ожидают изменений. Другая причина в том, что если вы говорите о TFS 2010 или ниже, то есть о рабочей области сервера, вам необходимо подключиться к серверу, а не к новому локальному рабочему пространству, представленному в бета-версии TFS 11. В любом случае, мой вам совет: просто используйте TFS Integration Tool для интеграции между двумя серверами.
http://tfsintegration.codeplex.com/