Используйте команду .Include()
:
var partidos = from q in this.FixturePartidoPuntaje.Include("children")
where (q.FixturePartido.Equipo.EquipoId.Equals(equipoId) ||
q.FixturePartido.Equipo1.EquipoId.Equals(equipoId)) &&
q.puntaje > 0
select q;
здесь "дети" - это название навигационного свойства, которое вы хотите включить, если у меня не осталось свободного места ...