ошибка загрузки данных (Read10X, Seurat - руководство по управляемой кластеризации) - PullRequest
Новая
       47

ошибка загрузки данных (Read10X, Seurat - руководство по управляемой кластеризации)

0 голосов
/ 11 апреля 2020

Я пытаюсь следовать руководству с сайта Seurat. https://satijalab.org/seurat/v3.1/pbmc3k_tutorial.html

При загрузке данных произошла ошибка.

Загрузка набора данных PBM C

pbm c .data <- Read10X ("1_Guided_tutorial / pbmc3k_filtered_gene_bc_matrices.tar.gz") </p>

Ошибка в Read10X ("1_Guided_tutorial / pbmc3k_filtered_gene_bected_beed * 101 * 1015") не каталогов * Я установил свой рабочий каталог, как показано на рисунке. Кто-нибудь может дать мне знать, в чем проблема? Спасибо!

enter image description here

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("multtest")

library(dplyr)
library(Seurat)
library(patchwork)

# Load the PBMC dataset
pbmc.data <- Read10X(data.dir = "1_Guided_tutorial/pbmc3k_filtered_gene_bc_matrices.tar.gz")
...