Первый опыт работы с файлом .loom здесь. Моя цель - заставить матрицу подсчета работать в Сёра позже. .loom / gene
(категория без категорий)
Я могу сгенерировать соединение с файлом .loom, используя:
alveolar <- connect(filename = "Thienpont_Alveolar_v4_R_fixed.loom", mode = "r+", skip.validate=T)
Но когда я пытаюсь увидеть как выглядит альвеолярный объект, у меня следующая ошибка:
> alveolar
Class: loom
ID: Object invalid
Так что я не могу получить доступ к матрице данных:
> alveolar[["matrix"]]
Error in (function () : id is invalid
Что означает проблема с «ID» и как чтобы решить эту проблему?
PS: skip.validate = T был обязательным для возможности подключения к файлу