Я не уверен, что вы запрашиваете резервное копирование хранимых процедур, а также всего остального или только хранимых процедур самостоятельно ...
Хранится в дампе со всем остальным:
mysqldump -R <dbname> #or
mysqldump --routines <dbname>
Только хранимые процедуры:
mysqldump -n -t -d -R <dbname> #or
mysqldump --no-create-db --no-create-info --no-data --routines <dbname>
Это помогает?