Проблема, связанная с отображением файлов вместо выполнения, не зависит от настройки safe_mode.
safe_mode крайне важно, чтобы ваши скрипты не могли выполнять потенциально небезопасные операции, которые могут позволить хакеру взломать ваш сервер.
Похоже, вам удалось случайно изменить настройку, которая фактически связывает .php файлы с mod_perl, чтобы они работали правильно, но если вы не знаете, что делаете, вам действительно следует включить safe_mode обратно.
Кроме того, как общее правило при отладке проблем: изменяет только одну вещь за раз, а затем проверяет между каждым изменением . Это поможет устранить ложные предположения о том, какие изменения на самом деле решили проблему ...