Предоставляет ли ваша система какой-либо интерфейс веб-службы (например, REST или SOAP)? Если вы хотите собрать систему PM как собственное приложение для iOS, вам следует забыть об uiwebview и создать пользовательский интерфейс самостоятельно. Получите данные удаленно из вашей системы PM (в виде XML, JSON и т. Д.), Проанализируйте их и обновите элементы пользовательского интерфейса. Таким образом, вы можете расположить и управлять своим пользовательским интерфейсом и данными по своему усмотрению.
Редактировать: если это не так, возможно, вам следует совместить представления вашего веб-приложения с iPhone (например, sencha touch, jquery mobile) и попробовать, например PhoneGap.