Такие вещи могут произойти, когда:
a) Установка Xcode 4.3 [.1] и когда Xcode 4.2 удален (об этом просит установщик), или если он никогда не был установлен.
Чтобы исправить это, вам необходимо установить дополнительные «Инструменты командной строки», чтобы получить полную установку.
Это можно сделать изнутри XCode, выполнив следующие действия: Пакет инструментов командной строки XCode 4.3 с неверной контрольной суммой
b) при установке XCode в каталоге, отличном от каталога по умолчанию,В этом случае вам нужно сообщить MonoDevelop, где находится Apple SDK.Вы можете изменить это в диалоге настроек MonoDevelop, расположениях SDK.