Эта проблема была зарегистрирована, воспроизведена и, по-видимому, исправлена для цели 7.1.
http://netbeans.org/bugzilla/show_bug.cgi?id=202673
Тем временем, после каждой полной загрузки вашего сайта, выполняйте поиск внутри пульта дистанционного управления.Окно консоли журнала для команды DELE (совпадение, целое слово).Это определит для вас, какие файлы были удалены, и вы можете повторно загрузить их.
Если это слишком утомительно и у вас есть время для перерыва на кофе, просто заново загрузите весь каталог после загрузки.
Похоже, это связано с функцией загрузки при сохранении, поэтомуесли вы отключите это, то, вероятно, проблема также исчезнет.
Вы можете захватить последнюю ночь, и проблема также должна быть решена, в соответствии с основным коммиттером.