Я решил добавить пользовательский шаг предварительной сборки для генерации необходимых файлов .tt:
<Exec Command=""%PROGRAMFILES(x86)%\Common Files\microsoft shared\TextTemplating\10.0\TextTransform.exe" template.tt -out template.cs" />
Этот метод также позволил мне легко передавать параметры (определенные в файле проекта) в шаблон с помощью -a; другая проблема, с которой я столкнулся.