Если вы можете получить доступ к обоим журналам через одну машину, тогда ваше предложение FROM может обязательно включать оба пути к каталогам журналов:
SELECT TOP 10 *
FROM \\server1\Logs\*ex*.log, \\server2\Logs\*ex*.log
В каждой среде, где мне приходилось анализировать журналы, у нас были процессы вместо для извлечения логов на один сервер, а затем мы выполняем любой анализ на этом компьютере (и он служит резервной копией).