Сначала вам нужно указать Apache прослушивать порты, которые вам нужны:
Listen 80
Listen 8089
Во-вторых, вы должны сказать ему, что делать с трафиком 80 и 8089:
<VirtualHost *:80>
DocumentRoot /website/site80
ServerName internet.dev
</VirtualHost>
<VirtualHost *:8089>
DocumentRoot /website/site8089
</VirtualHost>
В-третьих, вам нужно разрешить Apache использовать эти каталоги:
<Directory "C:/website/site80">
Options Indexes FollowSymLinks Includes ExecCGI
AllowOverride All
Order allow,deny
Allow from all
</Directory>
<Directory "C:/website/site8089">
Options Indexes FollowSymLinks Includes ExecCGI
AllowOverride All
Order allow,deny
Allow from all
</Directory>