Единого ответа на эту проблему не существует, отчасти потому, что сообщения об ошибках Apple не очень специфичны.
Для моего случая решение было таким:
Открыть скрипт Perl:
/Developer/Platforms/iPhoneOS.platform/Developer/usr/bin/PackageApplication
и вставьте эту строку вверху, как сразу после объявления «my $ xxxx»:
$ENV{CODESIGN_ALLOCATE} = '/Developer/Platforms/iPhoneOS.platform/Developer/usr/bin/codesign_allocate';
Кредит http://loopingrecursion.com/index.php?t=codesign за этот ответ.
Проблема, похоже, возникла после установки какой-либо бета-версии XCode 4.2 7. Я в итоге удалил ее и переустановил 4.1 с нуля, но все еще не мог проверить или поделиться, пока не применил это исправление.