Наложение не заканчивается автоматически, помните, что вы также можете наложить изображение вместо видео, например.
Дайте рамку для конца наложения, а затем продолжите исходное видео оттуда, вот так:
overlay(video, black).trim(0, 10) + video.trim(11, framecount(video))