Я использую cygwin на Windows 7 .Я использую инструмент обработки сигналов и в основном выполняю выравнивания.У меня было около 1200 входных файлов.Каждый файл имеет формат, указанный ниже.
input_file_ format = "AC_XXXXXX.abc"
Для первого шага требовалось построить какие-то индексы для всех входных файлов, это было сделано с помощью инструмента build-index
команда и теперь каждый файл имеет 6 индексов, связанных с ним.Поэтому сейчас у меня около 1200 * 6 = 7200 индексных файлов.Индексы имеют форму, приведенную ниже.
indexes_format = "AC_XXXXXX.abc.1",
"AC_XXXXXX.abc.2",
"AC_XXXXXX.abc.3",
"AC_XXXXXX.abc.4",
" AC_XXXXXX.abc.rev.1 ",
" AC_XXXXXX.abc.rev.1 "
Теперь мне нужно использовать эти индексы для выполнения выравнивания.Все 6 индексов каждого файла вызываются вместе, и последняя операция выполняется следующим образом.
signal-processing-tool ..\path-to-indexes\AC_XXXXXX.abc ..\Query file
, где AC_XXXXXX.abc - индекс, связанный с этимконкретный индексный файл.Все 6 индексных файлов вызываются с помощью ** AC_XXXXXX.abc *.
Моя проблема в том, что мне нужно использовать только первые 14 символов имен файлов индекса для заключительной операции.
Когда я использую код ниже, выравнивание не выполняется.for file in indexes/*; do ./tool $file|cut -b1-14 Project/query_file; done
Буду признателен за помощь в этом!