Боюсь, что переходная поддержка является экспериментальной в buildr, есть несколько проблем с ней.Вы можете попробовать перечислить зависимости вручную:
HIBERNATE = ["mysql:mysql-connector-java:jar:5.1.13",
"org.hibernate:hibernate-core:jar:3.5.5-Final",
"antlr:antlr:jar:2.7.6",
"commons-collections:commons-collections:jar:3.1",
"commons-pool:commons-pool:jar:1.5.4",
"commons-dbcp:commons-dbcp:jar:1.3",
"commons-lang:commons-lang:jar:2.5",
"dom4j:dom4j:jar:1.6.1",
"xml-apis:xml-apis:jar:1.0.b2",
"org.hibernate:hibernate-entitymanager:jar:3.5.5-Final",
"org.hibernate:hibernate-annotations:jar:3.5.5-Final",
"org.hibernate:hibernate-commons-annotations:jar:3.2.0.Final",
"org.hibernate.javax.persistence:hibernate-jpa-2.0-api:jar:1.0.0.Final",
"org.hibernate:hibernate-validator:jar:4.1.0.Final",
"javax.validation:validation-api:jar:1.0.0.GA",
"cglib:cglib-nodep:jar:2.2",
"javassist:javassist:jar:3.9.0.GA",
"javax.transaction:jta:jar:1.1",
"log4j:log4j:jar:1.2.16",
"org.slf4j:slf4j-api:jar:1.6.1",
"org.slf4j:jcl-over-slf4j:jar:1.6.1",
"org.slf4j:slf4j-log4j12:jar:1.6.1"]