просто добавьте свойство css "position as static" в родительский div, для которого вы устанавливаете полосу прокрутки.
$("selector").css("position","static");
ex.
$('.bottomSentences').draggable({
cursor: 'move',
helper: 'clone',
start: function(e, ui)
{
$(ui.helper).addClass("ui-draggable-helper");
$("#splitSentencesDiv").css("position","static");
}
});
здесь в ex.splitSentencesDiv - это мой Div, для которого я установил прокрутку.по умолчанию его значение положения относительно установлено классом начальной загрузки.