Обычно это не проблема, вы можете загрузить этот файл на ваш веб-сервер во временную папку. Чем вы должны преобразовать это. Например, есть расширение ffmpeg для php, но не поставляется с дистрибутивом php afaik.
Но даже если у вас этого нет, вы можете вызвать командную строку, например, в оболочке Linux
ffmpeg -i /sometmpfolder/tmp.wav destination.mp3