Сам JCR API не предоставляет простого способа сделать полное и восстанавливаемое резервное копирование всего хранилища (точно так же, как JDBC не охватывает функции резервного копирования / восстановления реляционных баз данных), поэтому ответ на ваш вопрос зависит от какую реализацию JCR вы используете.
Простое решение, которое должно работать с любой реализацией JCR, - закрыть хранилище и сделать резервную копию файловой системы / базы данных всех данных, используемых хранилищем.
Если вы используете Apache Jackrabbit , вы также можете использовать функцию резервного копирования , включенную в автономную банку Jackrabbit . Или, если вы предпочитаете Java API, вы можете получить доступ к той же функциональности, используя класс RepositoryCopier , включенный в ядро jackrabbit-core. При использовании RepositoryCopier вы можете даже оставить исходный репозиторий работающим до тех пор, пока на уровне приложения можно будет принудительно установить, что ни один клиент не будет пытаться выполнить запись в репозиторий во время выполнения резервного копирования.