Поскольку Nexus может работать с репозиториями s3 (см. тикет NEXUS-1121 ), я бы посоветовал вам записывать эти разные версии в репозитории артефактов, таких как Nexus, а не в VCS (контроль версий).Системный инструмент, такой как SVN, или, что еще хуже, распространяется как Git или Mercurial.
В VCS есть функции (ветвление, слияние, различие), которыми не могут воспользоваться большие двоичные файлы.