Убедитесь, что установка PEAR установлена правильно и доступна в среде Windows. Каждая команда PEAR имеет соответствующий файл .bat в каталоге установки PEAR, например, phpunit.bat. Потому что это файлы, которые вызываются при выполнении, например, phpunit в командной строке, этот каталог также должен быть в вашей переменной PATH. Наличие каталога PEAR только для include_path недостаточно.
Если вы уверены, что PEAR установлен правильно. переустановите PHPUnit с
pear install --alldeps --force phpunit/PHPUnit