Во-первых, вам нужен сервер, который может быть написан на Java, который будет обрабатывать данные между APP и сервером. Этот сервер также может взаимодействовать с вашим оборудованием, как вы сказали, с микроскопом. Вы можете найти набор команд для построения этого соединения между микроскопом и сервером. Например, вы используете сервер отправить команду: «сброс», она будет сброшена. Если вы отправите команду «сделать фото», она сделает фотографию. Таким образом, вам нужно отправить команды разнообразия, чтобы управлять им. Наконец, сервер будет обрабатывать эти данные среди приложений, серверов и оборудования. Поскольку в вашем вопросе не упоминалось, какое устройство указано, это просто большой график для его описания.
Удачи на этом.