API файловой системы является «виртуальным» в том смысле, что вы не можете хранить файлы буквально на компьютере клиента. Вы можете получить к ним доступ только через JavaScript.
Тем не менее, они хранятся с разными именами файлов в нескольких каталогах (с неинтуитивными именами) в:
%appdata%\Local\Google\Chrome\User Data\Default\File System
Где %appdata%
- например, C:\Users\xxx\AppData
(в Vista).