Я нашел ответ на этой странице .Я не вижу его нигде в переполнении стека, поэтому я опускаю его сюда.
Выйдите из BBEdit, если он запущен, затем введите в терминале командной строки следующее:
defaults write com.barebones.bbedit ReportReplaceAllResults -bool NO
Запустите BBEdit и наслаждайтесь отсутствием необходимости закрывать окно каждый раз, когда вы делаете Заменить все.