У меня была та же проблема, и хотя FXCop не поддерживает наборы правил, вы можете использовать недокументированный переключатель командной строки из FXCopCmd.exe.Просто укажите ключ / rid для сообщений, которые вы хотите подавить.Этот переключатель может происходить несколько раз.Например:
"$(ProgramFiles)\Microsoft FxCop 10.0\FxCopCmd.exe" /console /file:"$(TargetPath)" /rid:-Microsoft.Design#CA1005 /rid:-Microsoft.Design#CA1020
в событии после сборки вашего проекта VS 2008.
Hth Uli