Сервисные узлы. Предоставьте API для хранения данных и API для вычислений на этих сохраненных данных.
MPI отстой для повторного использования. HTTP - это новый канал Unix.
Хорошим стартовым проектом будет API молекулярной динамики. Введите JSON, возвращайте состояние системы каждый раз, когда запрашиваете узел, пока не попросите его остановить.