У меня была такая же проблема. Я использую Eclipse 4.3 (Kepler) и
Scala IDE для Eclipse 3.0.1.v-2_10-201307101641-eff8147. У меня есть проект maven scala, который я затмил и импортировал. Это работало просто отлично, но когда я импортирую пакеты java, весь файл больше не компилируется. Я смог заставить его скомпилировать снова, изменив порядок библиотек. Но тогда этот трюк больше не работал, и все мои файлы scala стали не компилируемыми. Я попробовал все предложенные здесь вещи (танец Затмения) безрезультатно.
Затем я попытался создать новый проект Scala в Eclipse. Я скопировал файл .classpath и каталог src из оригинального проекта - и так далее! Теперь он компилируется просто отлично. В файлах Eclipse, созданных maven, должна быть проблема.
ETA: я проверил мой файл .project, созданный maven. Это было указано в нем:
<buildCommand>
<name>org.eclipse.jdt.core.javabuilder</name>
</buildCommand>
И когда я вынул его, проблема исчезла. У меня тоже была другая проблема:
<comment>myproject. NO_M2ECLIPSE_SUPPORT: Project files created with the maven-eclipse-plugin are not supported in M2Eclipse.</comment>
Наверное, поэтому javabuilder появился на первом месте. Я должен был добавить скальпель, добавив Scala Nature в свой проект. Может быть, эта проблема не появится, если я добавлю плагин M2Eclipse. Я попробую и посмотрю.