Может быть, стоит подумать о том, чтобы иметь одно рабочее пространство с несколькими проектами (Java и Python), а затем просто переключать перспективы в зависимости от того, над чем работаете.В качестве альтернативы вы можете запустить несколько экземпляров Eclipse, по одному для каждой рабочей области, если вам нужно хранить их отдельно.Чтобы ответить непосредственно на ваш вопрос, я не верю, что то, что вы просите, легко возможно без потенциально специального плагина.