Весь смысл дерева слоев заключается в наследовании атрибутов, подобных преобразованиям. Если вы не хотите, чтобы определенные слои наследовали от их родителя, вставьте их как дочерние элементы другого слоя.
Вы также можете применить обратное преобразование к дочерним слоям, но это будет хакерским, требовательным к вычислениям и откроет путь к ошибкам округления.