Я бы порекомендовал поместить их в папку с именем app/assets/flash
.
Добавить эту папку в пути к активам:
config.assets.paths << Rails.root.join('app', 'assets', 'flash')
На них можно ссылаться следующим образом:
asset_path('name_of_swf')
Помощник asset_path обеспечит ссылку на правильный файл в режимах разработки и производства.