Убедитесь, что вы настроили внешнюю установку Maven в плагине m2eclipse.Зайдите в Window -> Preferences -> Maven -> Installation и настройте его там.Также обратите внимание, что плагин Maven, который поставляется с Indigo, не работает как предыдущие версии, и некоторые плагины Maven могут не поддерживаться напрямую.Кроме того, если вы ранее не использовали Maven 3 и у вас есть номера версий плагинов, закодированные в ваших POM, могут быть несовместимости, поскольку не все плагины, которые работали с Maven 2, работают и с Maven 3.Все должны иметь обновления, которые делают, хотя.Обратите внимание, что указание номеров версий плагинов - хорошая привычка, и Maven 3 предупредит вас, если вы этого не сделаете.Если вы этого еще не сделали, попробуйте собрать проект с помощью Maven 3 из командной строки, чтобы получить более точное представление о том, в чем заключается проблема.