Вот фрагмент кода из dev_appserver.py, который может помочь вам в правильном направлении:
from google.appengine.api import rdbms_mysqldb
from google.appengine import api
sys.modules['google.appengine.api.rdbms'] = rdbms_mysqldb
api.rdbms = rdbms_mysqldb
rdbms_mysqldb.SetConnectKwargs(host=mysql_host, port=mysql_port,
user=mysql_user, passwd=mysql_password,
unix_socket=mysql_socket)