Ваша команда немного отключена, вы должны использовать полный путь к ключу при вставке:
xml ed --net ^
-s /chksys/machine/registry -t elem -n key -v "" ^
-i /chksys/machine/registry/key -t attr -n value ^
-v "'C:\Program Files\Microsoft SQL Server'" ^
-i /chksys/machine/registry/key -t attr -n path ^
-v "HKLM\software\symantec\Symantec Endpoint Protection\AV\Exclusions\ScanningEngines" ^
OLDFILE > NEWFILE
Это поместит отредактированный XML в NEWFILE, если вы хотите изменить OLDFILE напрямую, вы можете использоватьопция --inplace или -L.
xml ed --net --inplace ^
...