mpirun не работает с двумя узлами - PullRequest
0 голосов
/ 03 апреля 2012

Я работаю в кластере, где каждый узел имеет 16 процессоров. Моя версия Open MPI 1.5.3. Я написал следующий простой код на фортране:

  program MAIN
  implicit none
  include 'mpif.h'
  integer status(MPI_STATUS_SIZE)
  integer ierr,my_rank,size


  integer irep, nrep, iex
  character*1 task


  !Initialize MPI
  call mpi_init(ierr)
  call mpi_comm_rank(MPI_COMM_WORLD,my_rank,ierr)
  call mpi_comm_size(MPI_COMM_WORLD,size,ierr)


  do iex=1,2

     if(my_rank.eq.0) then
        !Task for the master
        nrep = size

        do irep=1,nrep-1
          task='q'
          print *, 'master',iex,task
          call mpi_send(task,1,MPI_BYTE,irep,irep+1,
 &                     MPI_COMM_WORLD,ierr)
        enddo


     else
        !Here are the tasks for the slaves


        !Receive the task sent by the master node
        call mpi_recv(task,1,MPI_BYTE,0,my_rank+1,
 &                   MPI_COMM_WORLD,status,ierr)


        print *, 'slaves', my_rank,task


     endif

  enddo


  call mpi_finalize(ierr)

  end

затем я компилирую код:

/usr/lib64/openmpi/bin/mpif77 -o test2 test2.f

и запустите его с

/usr/lib64/openmpi/bin/mpirun  -np 32 -hostfile nodefile test2

мой нодфайл выглядит так:

node1
node1
...
node2
node2
... 

с узлами 1 и 2 повторяются по 16 раз каждый.

Я могу успешно скомпилировать. Когда я запускаю его для -np 16 (так что только один узел), он работает хорошо: каждый раб заканчивает свою задачу, и я получаю подсказку обратно в терминал. Но когда я пытаюсь -np 32, не все рабы заканчивают их работа только 16 из них.

На самом деле с 32 узлами программа не дает мне подскажите обратно, чтобы я думаю программа где-то сложена и ждет какая-то задача для выполнения.

Я хотел бы получить от вас какой-либо комментарий, поскольку я провел некоторое время в этом тривиальная проблема.

Спасибо.

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 20 июля 2012

вы пробовали mpiexec вместо mpirun?

0 голосов
/ 03 апреля 2012

Я не уверен, что ваш нод-файл правильныйЯ ожидаю увидеть такие строки:

node1 slots=16

OpenMPI довольно хорошо задокументирован, вы проверили их FAQ?

...