Вы можете проверить настройки в sh404sef - вы можете просмотреть настройки по компонентам:
Components -> sh404SEF -> Configuration Tab -> sh404sef configuration -> By Component tab
Это даст вам доступ к возможности изменять вещи в зависимости от языковых файлов и прочего.
Не уверен, поможет ли это, но я бы начал с этого. Также разработчики очень активны на своих форумах и очень помогают в таких ситуациях. Я не могу вспомнить, как хорошо Joomfish и sh404SEF играют вместе.