Отпечаток сертификата - это хэш открытого ключа сертификата
Действительно, нет.
Отпечаток большого пальца рассчитывается по всему сертификату в формате DER.
Вы можете получить его, например, с помощью флага -fingerprint из openssl x509 или с помощью любого инструмента вычисления хеша.