Мне пришлось добавить некоторые элементы в * extended_valid_elements *, чтобы он не удалял флэш-контент.
tinyMCE.init({
mode : “textareas”,
editor_selector:“mceEditor”,
theme : “advanced”,
theme_advanced_buttons1 : “bold,italic,underline,strikethrough,|,forecolor,backcolor,|,link,unlink,image,code”,
theme_advanced_buttons2 : “”,theme_advanced_buttons3 : “”,theme_advanced_buttons4 : “”,
theme_advanced_resizing : true, tab_focus : “:prev,:next”,
extended_valid_elements : “object[width|height|classid|codebase],param[name|value],embed[src|type|width|height|flashvars|wmode]“
});
Ответ найден на http://syedgakbar.wordpress.com/2008/01/28/adding-flash-embed-support-in-tinymce-editor/