Простой обходной путь против создания двух каталогов заключается в создании символической ссылки перед запуском:
ln -s example.com www.example.com
Но я полагаю, что wget все равно будет загружать один и тот же документ дважды, если он существует на обоих доменах, перезаписывая ранееодин.Похоже, что универсальная опция "эти URL-адреса эквивалентны" для wget по-прежнему отсутствует.